自清代医家吴鞠通的《温病条辨》以上、中、下三焦论述温病的证治以来，三焦辨证就成为温病辨证的方法之一。这是依据《内经》关于三焦所属部位的概念，在《伤寒论》及叶天士卫气营血辨证的基础上，结合温病传变规律的特点而总结出来的，着重阐述了三焦所属脏腑在温病过程中的病理变化，证候特点及其传变的规律。

　　三焦辨证是在阐述上、中、下三焦所属脏腑病理变化及其证候的基础上，同时也说明了温病初、中、末三个不同的阶段。三焦辨证认为：温病一般始于上焦手太阴肺，然后传入中焦脾胃，最后终于下焦肝肾。但是，由于温病有风温、春温、暑温、湿温、秋燥、伏暑、瘟疫等不同种类。因此，它们的发病和传变规律不尽相同。如暑温初起，即可表现为中焦病证。此外，三焦病证亦可以相兼互见。如湿温初起，多上、中二焦同时发病。

　　在三焦辨证中，邪在上焦主要表现为手太阴肺经和手厥阴心包经的病变。病在中焦则表现为脾胃功能障碍的证候。邪入下焦，主要反映出足厥阴肝和足少阴肾的病变。上、中二焦病变，多属实证。下焦病变，多为虚证。

上焦病证

　　风热袭表证：指风热邪气，侵袭肌表，影响肺卫功能所形成的证候。症见发热，微恶风寒，头痛咳嗽，口微渴，舌苔薄白，脉浮数。

　　热邪壅肺证：指热邪壅滞于内，肺气闭郁所形成的证候，症见发热汗出，咳嗽气喘，口渴，苔黄脉数。

　　邪陷心包证：指温热痰浊病邪，内陷心包，蒙闭心窍，扰乱心神所致的证候。症见发热，神昏谵语，舌蹇肢厥，舌质红绛，苔黄或黄腻，脉滑而数。

中焦病证

　　胃经热织症：指胃经火热，弥漫充斥，耗气灼津所表现的症候。症见壮热不恶寒，反恶热，面赤气粗，汗出口渴，舌苔黄燥，脉象洪大。

　　肠道热结证：指火热邪气与肠道积滞相互搏结，以致肠道腑气不通所表现的证候，叫做肠道热结证。症见发热，日脯尤甚，甚则神昏谵妄，腹胀便秘，小便短赤，苔黄黑焦燥，脉沉而有力。

　　湿热困脾证：指湿热之邪侵袭，气机郁阻，脾胃功能障碍所致的证候。症见身热不扬，不为汗解，缠绵难愈，胸闷脘痞，呕恶欲吐，身重肢倦，苔腻脉濡。

下焦病证

　　热耗肾阴证：指温病后期，热邪久留，耗损肾阴所表现的证候。症见发热，夜热早凉，或午后热甚，颧红，口干咽燥，精神倦怠，手足心热甚于手足背，舌质光红，舌体瘦小，脉沉细数。

　　阴虚动风证：指温病后期，阴血大伤，水不涵木，虚风内动的证候。症见手足蠕动或抽动，神情倦怠，心悸，舌红绛枯痿，或见舌体瘦小颤动，脉沉细弱。

　　此外，温病其它许多证候亦都可以归纳入三焦病证的范围之内，如温热犯卫证、燥热犯卫证、痰热壅肺证、燥热伤肺证、热郁胸膈证等等，均属于上焦病范畴。热郁胆经证、暑伤气津证等，属于中焦病之列。气热动风证、营热动风证、热入营分证、血热动血证、血热动风证等，属于下焦病的范畴。